GEO|TCGA|Oncomine数据挖掘教程-百度网盘-下载
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适用人群

对基因数据挖掘充满兴趣的医学工作者及科研人员

作者简介:

豪斯医生

上海交通大学医学院高材生,“医学方”明星讲师,本人已发表无数SCI,在医学数据挖掘,尤其是在GEO和TCGA方面,对寻找差异基因,GO富集分析,KEGG ,GEA ,WGCNA等有较深入的研究。通过幽默风趣的讲课方式,深入浅出地帮助各位医学工作者和科研人员一起攻克数据挖掘,最终发表属于自己的SCI。

这次课程是个基础加进阶的内容,也主要是面向我们的医学工作者和科研人员,但是千万不要小看这些课程,这些内容能很好得为我们今后想在这方面做得更深的学员打下结实的基础,也为我们学习这些R和PERL编程软件提供一个契机。另外我们想说的是,这些过程很多是我们做数据挖掘必做的步骤,所以如果在一开始没有掌握好,后面的学习将会非常困难。

课程简介:

你是否还为没有文章毕业而焦虑?你是否还为实验结果不尽人意而沮丧?你是否也想足不出户就可以完成一个小课题?这些零零种种的困扰和幻象,相信不会发生在一个人身上。那么今天,我们可不可以找到一种方法、抑或是捷径,让我们可以不惧怕这些问题,并做出一份很好的答卷,答案是肯定的!

“医学方”豪斯医生将跟大家一起交流数据挖掘的神奇之处。本课程相比市面上很多其他数据挖掘教程有很大优势,集合了GEO、TCGA、Oncomine三大数据库,从基础到高阶,既有基础的数据库介绍,也有R软件和perl等高阶工具的应用,带大家玩转基因数据,从最简单的数据下载到最后我们绘制一张5年生存率,这桌饕餮盛宴,一定符合大家的口味,一定让大家觉得物超所值!

课程大纲:

  • 数据挖掘概述
  • GEO在线工具的应用
  • GEO数据下载和数据质量分析
  • 原始数据预处理
  • 寻找差异基因及制作热图和火山图
  • GO富集分析
  • KEGG分析
  • 蛋白互作网络
  • TCGA数据下载
  • TCGA数据整理和基因注释

……



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